García llevó a Bélgica hasta los cuartos de final del Mundial de este mes, donde cayó ante la que sería la campeona, España, pero su futuro ya estaba en duda tras un torneo poco convincente.
El contrato del técnico francés finaliza a finales de este mes.
"Rudi García ha desempeñado sin duda un papel clave en la recuperación de los Diablos Rojos", señaló en un comunicado el director deportivo de la Federación, Vincent Mannaert.
"Fue nombrado seleccionador nacional en un contexto deportivo y financiero complicado. Gracias en particular a su compromiso y experiencia, se recuperó la cohesión del grupo y se logró un gran resultado en el último Mundial", añadió.
"En nombre de la Federación, quiero agradecer calurosamente a Rudi y a sus asistentes por estos 18 meses. Junto a mi equipo, actualmente estoy preparando un nuevo ciclo, que incluye el nombramiento de un nuevo seleccionador nacional".