El guardameta de 33 años del Barcelona, actualmente cedido en el Girona, fue operado en febrero de una rotura de isquiotibiales, la última de varias lesiones que ha sufrido.
En la rueda de prensa previa al amistoso del lunes ante Ghana en Stuttgart, Nagelsmann reveló que esta semana había hablado con Ter Stegen.
El técnico aseguró que es poco probable que el portero entre en la convocatoria para el Mundial.
"La posibilidad es muy, muy, muy escasa, porque hay que tener en cuenta la situación general", explicó Nagelsmann.
"No ha jugado durante un año y después se lesionó. Lleva, por así decirlo, un año fuera y ha tenido muy poca participación".
"Debe darlo todo en su recuperación... Pero ya no tiene 21 años. Ya acumula muchos partidos a sus espaldas".
"Le deseo lo mejor y cruzo los dedos por él, pero todos debemos tener paciencia".
Durante mucho tiempo suplente de Manuel Neuer, asumió la titularidad de Alemania cuando el campeón del Mundial 2014 se retiró tras la EURO 2024.
Nagelsmann había asegurado en febrero que Ter Stegen era el principal candidato para la portería de Alemania en el Mundial. Oliver Baumann, del Hoffenheim, fue titular en la victoria en un partido amistoso por 4-3 ante Suiza el viernes.