Crespo, de 49 años, vuelve al club después de casi cuatro años en el Morumbí.
El argentino firmó contrato con el Tricolor hasta el 31 de diciembre de 2026.
"Es un gran profesional que ya conoce el club, ganó un título aquí y llegó el momento de su regreso", dijo el presidente de la entidad, Julio Casares.
Hernán dirigirá al club del Brasileirao durante ocho meses. En 53 partidos, logró 24 victorias, 19 empates y 10 derrotas (57% de éxito). A pesar de ganar el Paulista de 2021 -sacando al equipo de una mala racha de nueve años-, acabó dejándolo tras una serie de malos resultados.
El argentino pasó entonces al Al-Duhail de Catar y al Al-Ain de Emiratos Árabes Unidos. En Oriente Próximo ganó cuatro trofeos, incluida la Liga de Campeones asiática.
H. Crespo se quedó sin club tras dejar ese último club el año pasado. El técnico regresa al São Paulo con el ayudante Juan Branda y el entrenador de porteros Gustavo Nepote.